Die mittelalterliche Dorfkirche ist vermutlich 1635 während des Dreißigjährigen Krieges abgebrannt. Der Turm und das Dach sind ganz oder teilweise zerstört worden. Größere Reparaturen an Kirche und Turm wurden wahrscheinlich schon im Jahr 1641 vorgenommen, die verbrannten Säulen im Inneren wurden "abgesägt" und "abgehauen". 1650 konnte die Gemeinde durch eine Schenkung ein neues Gestühl anschaffen, die Verpachtung einer Schafweide erlaubte es, eine Emporbühne zu bauen und einen Glockenstuhl aufzurichten. 1680 wurde "das Chor ganz neu aus dem Fundament erbauet".

Unter dem Turm der Kirche findet sich eine weitere, allerdings nur noch von außen sichtbare Tür. (Sie wurde im Rahmen der Umbauten der fünziger Jahre von Innen verschlossen, da sie als Zugang zu den Emporen durch den Anbau eines Treppenhauses hinter der Kirche nicht mehr benötigt wurde.) Während die anderen Sandsteinrahmen völlig glatt gearbeitet sind, weist dieser Rahmen Strukturen und Ornamente auf, die darauf schließen lassen können, dass er noch ein Überbleibsel der Vorgängerkirche ist.

Während der ersten Renovierung 1858 fand der Gottesdienst fünf Wochen lang in der Gemeindestube statt. Ein Jahr später reparierte man die Kirche auch außen, außerdem wurde ein silbernes Kruzifix auf dem Altar aufgestellt.

1873 wurde in den Dachreiter eine neue Turmuhr eingebaut, die auf den alten Bildern nur zur erahnen ist. Die Ausschreibung der Glöckner-Stelle vom Februar 1796 gibt einen Hinweis darauf, dass es bereits vor 1873 eine Turmuhr gegeben haben könnte. Unter den einzelnen Besoldungskriterien werden auch "Zwey Gulden und Fünfzig Sechs Kreuzer aus dem Kirchenkasten, und Zwey Gulden 45 Kr. aus der Burgermeisterei für Oel zur Uhr und Glocke" aufgeführt.

Eine im Nachlass des verstorbenen ehemaligen Kommunalpolitikers Willi Nutz gefundene "Behandlungs-Instruktion" nennt das Jahr in einer handschriftlichen Notiz auf der Rückseite. Diese Notiz bezieht sich auf Aussagen des Philipp Jakob Schilling, der Küster unserer Kirche war.
Die säuberlich geschriebene "Behandlungs-Instruktion für die neue Thurmuhr in Bischofsheim" gibt einen Einblick in die Arbeit, die mit der Uhr verbunden war:

"Die Uhr soll täglich gleichzeitig aufgezogen werden, jedoch soll dies während dem Schlagen nicht stattfinden.
Bevor das Gehwerk aufgezogen wird, muß auf dessen rechter Seite der Aufzieh-Schlüssel angesteckt, und durch eine kleine Umdrehung ein Ersatz-Gewicht eingehängt werden, damit die Uhr während dem Aufziehen fortgeht. Dann soll nur so viel Seil auf die Seilwalzen aufgewickelt werden, bis alle darauf eingedrehten Gänge voll sind. Zur leichten Beachtung könnte an den Seilen ein leicht sichtbares Zeichen, etwa durch ein rothes Bändchen angebracht werden.
Wenn die Seile zusammenlaufen oder sich verschränken, und deshalb die Gewichte nicht mehr mit der vollen Schwere wirken, dürfen dieselben nur an ihren oberen Enden, wo sie mit einem Knopfe oder auch in einem Haken aufgehängt sind, rückwärts aufgedreht werden.
Verlängern sich mit der Zeit die Seile, so daß die Gewichte nicht mehr ganz aufgezogen werden können ohne doppeltes Aufeinanderwinden der Seile, was nicht sein darf, oder daß die Gewichte zu früh am Boden aufstehen, so sind dieselben an ihrem oberen Ende so viel nachzuziehen und zu verkürzen, bis die Gewichte wieder oben anstehen, wenn die Seilgänge der Walzen alle voll sind."

Auf der Rückseite der Instruktion findet sich dies handschriftliche Notiz vom Juni 1949, die das Einbaujahr der Turmuhr festhält. Sie bezieht sich auf die Aussage von Philipp Schilling, von dem die Pfarrchronik weiß, dass er bis über sein 75. Lebensjahr hinaus das Amt des Kirchendieners mit großem Engagement wahrgenommen hat. So ist zu vermuten, dass er selbst noch mit der Wartung der 1935 abgebauten Turmuhr befasst war.

Mit dem Abbruch des alten Dachreiters 1935 verschwand auch die Turmuhr. Im Eingemeindungsvertrag mit der Stadt Mainz waren zwar für Bischofsheim diverse öffentliche Uhren vorgesehen, darunter auch eine für den neuen Kirchturm (eine entsprechende Blaupause, die den geplanten Turm mit den in Gauben angebrachten Zifferblättern zeigt, befindet sich noch im Archiv der Kommune), die Planungen wurden aber nicht realisiert.

Am 1. Januar 1861 wurden als "Neujahrsgabe" Bilder der beiden Reformatoren Luther und Melanchthon in der Kirche aufgehängt, die ein paar Monate später noch durch ein Bildnis Gustav Adolfs ergänzt wurden.

Um im Winter den Zug in der Kirche in Folge schlechter Türen zu vermindern, wurde 1887 an den Haupttüren des Gotteshauses nach innen eine zweite Tür (gepoltert) errichtet, die am Weihnachtsfest in Gebrauch genommen wurde. Für Altar und Kanzelbekleidung wurden zu weiterem Gebrauch im Sommer Schutzdecken gefertigt. 1888 erhielt die Kirche einen neuen Außenanstrich.

Eine umfangreiche Innen- und Außenrenovierung erfolgte nach Ostern und Konfirmation 1902. Der Turm wurde neu gedeckt und erhielt einen neuen Hahn. Das übrige Dach wurde nur umgedeckt, die Mauern bekamen einen neuen Anstrich. Die Erneuerungsarbeit im Inneren der Kirche ging nicht so rasch voran.
Die meiste Zeit beanspruchte die Wiederherstellungsarbeit der Deckengemälde.

Erst sieben Wochen nach Pfingsten konnte wieder in das Gotteshaus eigezogen werden. Während der ganzen Zeit der Wiederherstellung der Kirche wurde der Gottesdienst in dem der Gemeinde von Bürgermeister Wiesenecker freundlicherweise zur Verfügung gestellten großen Saal seiner Wirtschaft abgehalten. Die Kosten, für die Gemeinde und Fiskus aufzukommen hatten, betrugen 5.000 Mark. Nicht eingerechnet ist hierbei die Summe, die die Erneuerung der Gemälde benötigte. Diese, 1.450 Mark, bezahlte die Kirche, obwohl sie nicht die Baulast hatte. Gegen Ende des Jahres 1909 bekam die Kirche eine elektrische Beleuchtungsanlage.

Im Jahr 1957 wurde durch eine Vergrößerung der Gemeinde eine Erweiterung der Kirche notwendig. Eine äußere Vergrößerung kam aus Denkmalschutzgründen nicht in Frage. So musste durch inneren Umbau der nötige Raum geschaffen werden. Hierfür wurden nach den Plänen von Architekt Benner, Wiesbaden, folgende Baumaßnahmen durchgeführt:

Die alte Turmkonstruktion wurde durch eine neue Stahlkonstruktion abgefangen, die Treppen unter dem Turm beseitigt und eine neue Treppe zu den Emporen, außerdem eine Toilette mit Waschraum, an der Nordwestseite des Turmes angebaut. Die vorhandene Empore wurde verbreitert und das gesamte Gestühl auf den Emporen durch Klappsitze erneuert. Der Lehrerstuhl wurde beseitigt, an seiner Stelle kam der neue Taufstein. Insgesamt wurden 100 neue Sitzplätze geschaffen.

Ein völlig verändertes Erscheinungsbild bekamen auch die Kirchenfenster. Zwar blieb unsere Kirche während der Luftangriffe des 2. Weltkrieges von Zerstörung weitgehend verschont, die Glasfenster des Kirchenraumes allerdings hatten durch Druckwellen Schaden genommen. Das barocke Bauwerk hat wohl nie über besonders gestaltete Fenster verfügt. Alte Fotos - wie etwa eine Postkarte aus den 30-er Jahren - zeigen einfache Glasscheiben, die so gefasst waren, dass die Fensterform nachgebildet wurde.

Im Zuge der Innenrenovierung 1959 wurden die Fensterflächen komplett erneuert und die geometrische Aufteilung mit Buntglas gefüllt. Zur Finanzierung der Fenster trugen die gemeindlichen Gremien, aber auch Handwerksbetriebe, Ärzteschaft und viele Gemeindeglieder mit ihren Spenden bei - wie heute noch in den Fenstern zu lesen ist. Das Rundfenster über dem Haupteingang zeigt das Wappen Schlesiens und erinnert damit an die vielen Vertriebenen, die nach 1945 nach Bischofsheim kamen und ebenfalls ihren Teil zur Neugestaltung der Kirche beitrugen.

Der ehemals flache Turm erhielt einen 14 m hohen Turmhelm mit dem restaurierten Wetterhahn. Die Gesamthöhe des Turms beträgt 34 m. Außerdem erhielt der Turm auf der Westseite ein neues Fenster und die Kirche neue Beleuchtungskörper. Eine Heißluftumwälzheizung, die mit Öl oder Kohle befeuert werden konnte, sorgte für gute Beheizung.

Bei den Arbeiten wurden mehrere Gräber im Boden der Kirche freigelegt, darunter auch das des Eckardus Spar von Ortenberg, dessen bemerkenswerte Grabplatte aus rotem Sandstein heute an der rechten Seitenwand des Alttaraumes angebracht ist. Vermutlich handelt es sich bei den Gräbern um Ruhestätte vorreformatorischer Pfarrer, so vermutet es zumindest die Pfarrchronik.

Altar, Taufstein und Kanzel wurden aus Lahnmarmor neu gefertigt und ein neues Altarkreuz angeschafft. Die Kosten betrugen rund 100.000 DM, von denen die politische Gemeinde 30.000 DM Ablösung zahlte, 30.000 DM wurden durch Spenden aufgebracht, der Rest durch ein Darlehen und einen Zuschuß der Gesamtkirche. Die Gottesdienste fanden während der Renovierungszeit im Gemeindesaal statt. Die Einweihung der Kirche erfolgte am 17. November 1957.

Im September 1968 wurden umfassende Renovierungsarbeiten an der Außenfassade beendet und die Kirche präsentierte sich in "neuem" Barockstil. Zunächst waren die Grundmauern rings um die Kirche isoliert worden, da die Feuchtigkeit fast über drei Meter im Mauerwerk hoch gezogen war. Anschließend erhielt die Fassade einen gelblichen Anstrich, die Pilaster wurden Sandsteinfarben gestrichen. Auf 30.000 DM waren die Kosten veranschlagt, fielen aber wohl höher aus. Lediglich 5000 DM an Spenden und Kollekten konnte die Kirchengemeinde selbst dafür aufbringen, denn drei zuvor war erst eine neue Orgel angeschafft worden, die die Finanzen der Gemeinde auf einen Nullpunkt gebracht hatte. Den Rest musste die Kirchenverwaltung in Darmstadt tragen.

Im Sommer 1983 wurde die Umwälzheizung durch eine modernere Ölheizung ersetzt, wodurch nicht nur die Heizkosten gesenkt wurden, sondern auch die Verschmutzung von Orgel und Kirchenraum gebremst wurde. Dazu waren umfangreiche Arbeiten notwendig: Die Luftschächte der alten Heizung wurden stillgelegt, unter jeder Sitzbank Radiatoren angebracht und entsprechende Leitungen in den Wänden und Fußböden verlegt.

Trotz dieser umfangreichen Sanierungsarbeiten bleibt die 270 Jahre alte Kirche eine Dauerbaustelle:

So mussten im Oktober 2009 die Fachungen in den beiden Außentüren erneuert werden. Die Firma Munk aus Hochheim führte die Arbeiten aus und fertigte neue Fachungen aus Eichenholz. Die Bischofsheimer Firma Haus, die auch schon bei der Innenrenovierung 1993 tätig war, sorgte für den fachgerechten Anstrich.

2012 traten dann Erosionserscheinungen an den Portalwangen und den Sandsteinverblendungen im Sockel auf. Die beiden schadhaften Portale wurden im April 2017 saniert. Dazu wurden die beschädigten Teile heraus geschnitten und durch neue Sandsteinblöcke ersetzt. Zusätzlich wurden auch die Schwellen erneuert, sowie die alten Eisenanker das Hauptportals durch Edelstahlanker ersetzt, um so den Aufstieg von Feuchtigkeit und daraus folgende Korrosion zu unterbinden.